RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TIFA	Q96CG3	184 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP4	Q96JB8	637 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SCLT1	Q96NL6	688 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMP4	Q99727	224 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RPTOR	Q8N122	1335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DRGX	A6NNA5	263 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD9	O00144	591 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	APAF1	O14727	1248 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PJA2	O43164	708 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP5K1C	O60331	668 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD3B1	P14060	373 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AK2	P54819	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SESN3	P58005	492 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-21	P61565	698 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS15	P98073	1019 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZVL8	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CMIP	Q8IY22	773 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	REPS2	Q8NFH8	660 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TNIP3	Q96KP6	325 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC14	Q96N46	770 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ACAP3	Q96P50	834 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ORAI2	Q96SN7	254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DPP7	Q9UHL4	492 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	POLG2	Q9UHN1	485 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ANP32C	O43423	234 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ULK1	O75385	1050 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKD3	O94806	890 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NTN1	O95631	604 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCG	P05129	697 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ELANE	P08246	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PF4V1	P10720	104 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCND1	P24385	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP5	P24588	427 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ITPKB	P27987	946 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TM4SF4	P48230	202 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CHN2	P52757	468 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CLRN1	P58418	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	STK3	Q13188	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BIRC3	Q13489	604 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GALE	Q14376	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GRM3	Q14832	879 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ELF2	Q15723	593 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRM1	Q16186	407 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK18	Q7Z418	384 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7D4	Q8NG98	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RAX2	Q96IS3	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BCO1	Q9HAY6	547 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	VTA1	Q9NP79	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF1	Q9NS23	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	POGK	Q9P215	609 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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