RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 YAF2Q8IY57 180 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 IRF7Q92985 503 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 BCO2Q9BYV7 579 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.23■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SCN1AP35498 2009 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 TCHHQ07283 1943 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DPYSL4O14531 572 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ITGB3P05106 788 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 MAGEA9P43362 315 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 EPHA5P54756 1037 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 MYL7Q01449 175 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 BFSP1Q12934 665 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 E2F4Q16254 413 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 WSCD1Q658N2 575 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 SHC4Q6S5L8 630 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PJA1Q8NG27 643 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DNASE1L2Q92874 299 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ASB16Q96NS5 453 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 IKZF4Q9H2S9 585 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 UBE4BO95155 1302 aa18.22■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ANK1P16157 1881 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 MAN2B1O00754 1011 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 GFRA3O60609 400 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PSMC3P17980 439 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 TEAD2Q15562 447 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 UNC13DQ70J99 1090 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PSMG2Q969U7 264 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 FNBP1Q96RU3 617 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.21■□□□□ 0.51
CASP9-211ENST00000546969 FAM170BA6NMN3 283 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ZNF263O14978 683 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 CDC25CP30307 473 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 LHX1P48742 406 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 SPATA18Q8TC71 538 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 PHOX2BQ99453 314 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PRU2 124 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 PROB1E7EW31 1015 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 PCSK1P29120 753 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 GDI1P31150 447 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 NBL1P41271 181 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 CCR2P41597 374 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 AFMP43652 599 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 GRM2Q14416 872 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 RESP18Q5W5W9 173 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 TMEM209Q96SK2 561 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 ACBD6Q9BR61 282 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 FOXQ1Q9C009 403 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 USP25Q9UHP3 1055 aa18.19■□□□□ 0.5
CASP9-211ENST00000546969 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms