RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G6	O60733	806 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TOX4	O94842	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TH	P07101	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SRGN	P10124	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GYPE	P15421	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFR2	P21802	821 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PHKA1	P46020	1223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RAC3	P60763	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TGFB2	P61812	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM8	P78325	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BLMH	Q13867	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	STARD3	Q14849	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GGT6	Q6P531	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MYOC	Q99972	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BTN3A1	O00481	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GRM6	O15303	877 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FFAR2	O15552	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MTSS1	O43312	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD17	O75943	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD16A	O95870	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IL2RB	P14784	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CASR	P41180	1078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MEOX1	P50221	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RRAD	P55042	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP2	Q05923	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SP140	Q13342	867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TBR1	Q16650	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZSN1	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	EXTL1	Q92935	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRM	P28827	1452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R3H8	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PLSCR1	O15162	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1R1	P14778	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC6A4	P31645	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT5	P48643	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY7	P51828	1080 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BPIFB4	P59827	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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