RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-208	ENST00000525809	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-208	ENST00000525809	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TISP43	B9A030	160 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LILRB5	O75023	590 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GABRR2	P28476	465 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PNPLA4	P41247	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	STRA6	Q9BX79	667 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MYMK	A6NI61	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ARNTL	O00327	626 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PPP1R37	O75864	691 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SOAT2	O75908	522 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CHRNB1	P11230	501 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SYT1	P21579	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CCNE1	P24864	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CDC25C	P30307	473 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ADSS	P30520	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CXCL12	P48061	93 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CCR3	P51677	355 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	REST	Q13127	1097 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ALCAM	Q13740	583 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SV2C	Q496J9	727 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GCNT3	O95395	438 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	IDE	P14735	1019 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SDHB	P21912	280 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GART	P22102	1010 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TSPY1	Q01534	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC32	Q14392	662 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-208	ENST00000525809	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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