RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TTC13Q8NBP0 860 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 URGCPQ8TCY9 931 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 NAGPAQ9UK23 515 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ANK1P16157 1881 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA0355O15063 1070 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 HOXA2O43364 376 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 MMEP08473 750 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 PAEPP09466 180 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 FAM163BP0C2L3 166 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 PAX3P23760 479 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 GNA15P30679 374 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGAP25P42331 645 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 RAP1GAPP47736 663 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 LILRA4P59901 499 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TUSC3Q13454 348 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 IKBKEQ14164 716 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 UROC1Q96N76 676 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 SDCBP2Q9H190 292 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ACP6Q9NPH0 428 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 INTUQ9ULD6 942 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 NENFQ9UMX5 172 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ATP8B3O60423 1300 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 SPTLC1O15269 473 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 THAP12O43422 761 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 CILPO75339 1184 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 ZNF394Q53GI3 561 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 H2AFVQ71UI9 128 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 TMEM199Q8N511 208 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 APPL2Q8NEU8 664 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 WHAMMQ8TF30 809 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 CITO14578 2027 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0U1RQJ8 604 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRPS1-210ENST00000519815 CYB561D2O14569 222 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 MED7O43513 233 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 KIF5CO60282 957 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 RTN2O75298 545 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TACC1O75410 805 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 CALCAP01258 141 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 TNNT1P13805 278 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 CLCNKBP51801 687 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-210ENST00000519815 NDST1P52848 882 aa11.11□□□□□ -0.63
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