RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 MED23Q9ULK4 1368 aa5.42□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 C9orf118A6NHY6 69 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ERC2O15083 957 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ALADP13716 330 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 CSF2RBP32927 897 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 PCOLCEQ15113 449 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 MCM10Q7L590 875 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 C1QL4Q86Z23 238 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 FAM89AQ96GI7 184 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 TEKT5Q96M29 485 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 WDR92Q96MX6 357 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 CDH23Q9H251 3354 aa5.41□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ABLIM3O94929 683 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 SLC5A3P53794 718 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 SLC20A2Q08357 652 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 COPS6Q7L5N1 327 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 HERVK_113Q902F9 699 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 TOX2Q96NM4 488 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 MIS18AQ9NYP9 233 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 COG5Q9UP83 839 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 INVSQ9Y283 1065 aa5.4□□□□□ -1.54
HFE-212ENST00000485729 MROH6A6NGR9 719 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 DBX1A6NMT0 343 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 NOBOXO60393 691 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 NRP2O60462 931 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 C5AR1P21730 350 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 RRADP55042 308 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CD69Q07108 199 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 MGAT5Q09328 741 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ADAM15Q13444 863 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 KCTD2Q14681 263 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 LRRC41Q15345 812 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CPA6Q8N4T0 437 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 PPM1NQ8N819 430 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 TEPSINQ96N21 525 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CDH19Q9H159 772 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 VWA7Q9Y334 891 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ATRXP46100 2492 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.39□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 E2F8A0AVK6 867 aa5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 CLGNO14967 610 aa5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 TRIM13O60858 407 aa5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 NDUFS2O75306 463 aa5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
HFE-212ENST00000485729 LY86O95711 162 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms