RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 KPNA7A9QM74 516 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 STX6O43752 255 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R37O75864 691 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SCN1AP35498 2009 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SMARCB1Q12824 385 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A14Q15043 492 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 POTEHQ6S545 545 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 FAM3CQ92520 227 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PSMG2Q969U7 264 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 USP28Q96RU2 1077 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TMEM206Q9H813 350 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PANK4Q9NVE7 773 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 VNN2O95498 520 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GABRR2P28476 465 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R5DQ14738 602 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PDILTQ8N807 584 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CLDN23Q96B33 292 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 MTMR6Q9Y217 621 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SOAT2O75908 522 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GARTP22102 1010 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TSPY1Q01534 308 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GPR158Q5T848 1215 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TMC8Q8IU68 726 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SAAL1Q96ER3 474 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 LRRC3Q9BY71 257 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CDC25CP30307 473 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ADSSP30520 456 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 KCNA1Q09470 495 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 WSCD1Q658N2 575 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 MSANTD3Q96H12 275 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 STRA6Q9BX79 667 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CHADO15335 359 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ITGB3P05106 788 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 KRT19P08727 400 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 AMPD3Q01432 767 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 IER2Q9BTL4 223 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 BACH2Q9BYV9 841 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 EXTL3O43909 919 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 HUS1O60921 280 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 GIPC2Q8TF65 315 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 RUBCNQ92622 972 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 TASP1Q9H6P5 420 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-212ENST00000484841 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 SPTLC2O15270 562 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-212ENST00000484841 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.7■■□□□ 1.06
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