RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482083.7

RNF13-213, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-213	ENST00000482083	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	IPP	Q9Y573	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083		F5H697	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TRIM38	O00635	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NDUFS2	O75306	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NXPH3	O95157	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NDUFV1	P49821	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ETFDH	Q16134	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	REPS1	Q96D71	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	MYO1F	O00160	1098 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PPP6C	O00743	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CHEK2	O96017	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TCF15	Q12870	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TISP43	B9A030	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TUBB4A	P04350	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CYP2C19	P33261	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	JADE3	Q92613	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF213	O14771	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	JUP	P14923	745 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NDUFB7	P17568	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	EDNRB	P24530	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	TBCC	Q15814	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF13-213	ENST00000482083	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	F2RL2	O00254	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	PPEF2	O14830	753 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	ITGAL	P20701	1170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	C5AR1	P21730	350 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	IL10RA	Q13651	578 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	CLUL1	Q15846	466 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	NELL2	Q99435	816 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RNF13-213	ENST00000482083	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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