RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MRE11	P49959	708 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	EPHB3	P54753	998 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	GNAI1	P63096	354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC96	Q2M329	555 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PRR16	Q569H4	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ADCY6	O43306	1168 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MTSS1	O43312	755 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	KLHL18	O94889	574 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	VDR	P11473	427 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	COL6A1	P12109	1028 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ITGB5	P18084	799 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ABCB4	P21439	1286 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TEC	P42680	631 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	KCNJ5	P48544	419 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MAPK10	P53779	464 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	RRAD	P55042	308 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CTXN1	P60606	82 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PTH1R	Q03431	593 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	GRM1	Q13255	1194 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	DAG1	Q14118	895 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SPATA5	Q8NB90	893 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CASS4	Q9NQ75	786 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ING3	Q9NXR8	418 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	NTM	Q9P121	344 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SLIT3	O75094	1523 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MYO1F	O00160	1098 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ADAM23	O75077	832 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	TOX4	O94842	621 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PAPLN	O95428	1278 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	FGA	P02671	866 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	AMY1A	P04745	511 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	CD1A	P06126	327 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF28	P17035	718 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PPM1A	P35813	382 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	BPIFB4	P59827	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	FMO1	Q01740	532 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ICA1	Q05084	483 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	SP140	Q13342	867 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	BIRC3	Q13489	604 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MTM1	Q13496	603 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	STARD3	Q14849	445 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	MLANA	Q16655	118 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105		Q6ZUG5	572 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	NBPF11	Q86T75	865 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PUM2-208	ENST00000432105	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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