RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 RNF220Q5VTB9 566 aa10.23□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF23P17027 643 aa10.23□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.23□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 E9PBE3 544 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 TRIM73Q86UV7 250 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 OR6P1Q8NGX9 317 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SNX19Q92543 992 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 MTFR1Q15390 333 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 SOX13Q9UN79 622 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 CHN2P52757 468 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-202ENST00000402738 TRAF2Q12933 501 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LAMC2Q13753 1193 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 SMTNL2Q2TAL5 461 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 CALML6Q8TD86 181 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-202ENST00000402738 LXNQ9BS40 222 aa10.22□□□□□ -0.77
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