RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 PASD1Q8IV76 773 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 HIPK3Q9H422 1215 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 ENC1O14682 589 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 PALMO75781 387 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 GRIK3Q13003 919 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 ORC1Q13415 861 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.62■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.62■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.62■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.61■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.61■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 POMCP01189 267 aa21.6■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 CD19P15391 556 aa21.6■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 MON1BQ7L1V2 547 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 APBB2Q92870 758 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 TBX21Q9UL17 535 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 COG5Q9UP83 839 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 TTC3P53804 2025 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 PODXLO00592 558 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 MED7O43513 233 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 UNC93AQ86WB7 457 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 SEPT8Q92599 483 aa21.6■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF653Q96CK0 615 aa21.6■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 ENPP3O14638 875 aa21.59■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 MTA2O94776 668 aa21.59■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.59■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.59■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.58■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 PTP4A2Q12974 167 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 TCTN1Q2MV58 587 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 APPL2Q8NEU8 664 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.58■■□□□ 1.05
HDDC3-202ENST00000394272 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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HDDC3-202ENST00000394272 TUSC3Q13454 348 aa21.58■■□□□ 1.04
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HDDC3-202ENST00000394272 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM11Q96F44 468 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
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