RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379567.6

AP5S1-202, Transcript of adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AP5S1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1-202ENST00000379567 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 LINC01553A4QN01 128 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 PMM2O15305 246 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC172P0C7W6 258 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SAAL1Q96ER3 474 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 L1RE1Q9UN81 338 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 LRRN2O75325 713 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 POMCP01189 267 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 MCM3P25205 808 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 TNFSF9P41273 254 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 PAFAH1B1P43034 410 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ACOT2P49753 483 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 MXI1P50539 228 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SCNN1GP51170 649 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ST7Q9NRC1 585 aa20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CDH23Q9H251 3354 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 TAP1Q03518 808 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 HDXQ7Z353 690 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GPD1LQ8N335 351 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 LRCH3Q96II8 777 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SNX27Q96L92 541 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 RNF14Q9UBS8 474 aa20.1■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 EXTL3O43909 919 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF15O94989 841 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CXCL8P10145 99 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 MS4A14Q96JA4 679 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 FBXL18Q96ME1 805 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 MIOSQ9NXC5 875 aa20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GALCP54803 685 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 GRIK3Q13003 919 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 XKR4Q5GH76 650 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CNTN3Q9P232 1028 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 HCSTQ9UBK5 93 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 SZT2Q5T011 3432 aa20.08■□□□□ 0.81
AP5S1-202ENST00000379567 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 PTGESO14684 152 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 THP07101 528 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 TNFAIP3P21580 790 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 DNA2P51530 1060 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 TMC2Q8TDI7 906 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 CWH43Q9H720 699 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 AAASQ9NRG9 546 aa20.08■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 RPS6KA1Q15418 735 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 FAM212AQ96EL1 285 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 SAMD11Q96NU1 681 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 CITO14578 2027 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 NCANO14594 1321 aa20.07■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 ZNF233A6NK53 670 aa20.06■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
AP5S1-202ENST00000379567 ZMYND10O75800 440 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms