RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-202ENST00000370826 MYADML2A6NDP7 307 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC119BA6NIH7 251 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 TBX3O15119 743 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PPFIA4O75335 1185 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS4BO75351 444 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKL5O76039 1030 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC5CO95185 931 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD16AO95870 558 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 THP07101 528 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MXRA7P84157 204 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 TP53BP2Q13625 1128 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 APIPQ96GX9 242 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MLST8Q9BVC4 326 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 DPH1Q9BZG8 443 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PS29 197 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ISM1B1AKI9 464 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 BTN3A1O00481 513 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SUV39H1O43463 412 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MGEA5O60502 916 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF10O60809 474 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDEFO95238 335 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MC2RQ01718 297 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCY1B3Q02153 619 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAPQ12770 1279 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 DYRK1AQ13627 763 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 CNGA2Q16280 664 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 GEN1Q17RS7 908 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 KSR2Q6VAB6 950 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SUCLG2Q96I99 432 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SRRDQ9UH36 339 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM50BQ9Y247 325 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 E7ENX8 843 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 APAF1O14727 1248 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D4O60343 1298 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF202O95125 648 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 GRPP07492 148 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 MAKP20794 623 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC11A2P49281 568 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 VAV2P52735 878 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-202ENST00000370826 FMO1Q01740 532 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 TAP2Q03519 686 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 FPGSQ05932 587 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 CTBP1Q13363 440 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR149Q86SP6 731 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8N1X5 172 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 PJA1Q8NG27 643 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 APOL5Q9BWW9 433 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-202ENST00000370826 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.81□□□□□ -1.64
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