RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 F8W8V4 182 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ENTPD3O75355 529 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCND1P24385 295 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFNA8P32881 189 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 AMHR2Q16671 573 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCND2Q9NZV8 630 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAGAPQ8N103 731 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 IPMKQ8NFU5 416 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOD2Q9HC29 1040 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PAK5Q9P286 719 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ASB14A6NK59 587 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFHBQ8N7U6 833 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RIT2Q99578 217 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPRMP28827 1452 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR93Q6P2C0 686 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GGA3Q9NZ52 723 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 URGCPQ8TCY9 931 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM151AQ8WW52 585 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RSAD1Q9HA92 442 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TPST1O60507 370 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLI1P08151 1106 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NFKBIAP25963 317 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMOX2P30519 316 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCNK16Q96T55 309 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 HAO1Q9UJM8 370 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYL2P10916 166 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 E9PCH4 1651 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERPINB9P50453 376 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYGBQ8WWM9 190 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 LZICQ8WZA0 190 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBX20Q9UMR3 447 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAN1A2O60476 641 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARP10275 920 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP6V1B1P15313 513 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 OTULINQ96BN8 352 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EXTL3O43909 919 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPD1P21695 349 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.9 ms