RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 VPS41P49754 854 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GPC2Q8N158 579 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 RNF149Q8NC42 400 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 CSADQ9Y600 493 aa20.69■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TNNC2P02585 160 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TFDP1Q14186 410 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ERICH1Q86X53 443 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FAM212AQ96EL1 285 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TTC25Q96NG3 672 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MCEEQ96PE7 176 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM120BA0PK00 339 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ABLIM1O14639 778 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 B4GALT4O60513 344 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A27O95847 323 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 SLC26A2P50443 739 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PRKG1Q13976 671 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF699Q32M78 642 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC38Q502W7 563 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.68■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MED7O43513 233 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PROZP22891 400 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 P3H1Q32P28 736 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GPR20Q99678 358 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ACKR2O00590 384 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GJB6O95452 261 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MAGEA4P43358 317 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 NR1H3Q13133 447 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 LY6KQ17RY6 165 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ALLCQ8N6M5 410 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 LHX5Q9H2C1 402 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GSTA1P08263 222 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 HOXC6P09630 235 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 KAZNQ674X7 775 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 VSTM1Q6UX27 236 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 F8VP50 259 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 DNM1LO00429 736 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 IL18RAPO95256 599 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 SCTRP47872 440 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 IFNAR2P48551 515 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 MORF4L2Q15014 288 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FZD8Q9H461 694 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PPCSQ9HAB8 311 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ITGAVP06756 1048 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 KRT10P13645 584 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 BRAFP15056 766 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ASPAP45381 313 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ICE2Q659A1 982 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS1-201ENST00000311008 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms