RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 PTP4A2Q12974 167 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 LLGL1Q15334 1064 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 SRLQ86TD4 932 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 UBR7Q8N806 425 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 FAM212AQ96EL1 285 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 NLRP4Q96MN2 994 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 ABLIM1O14639 778 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 ZEB2O60315 1214 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 C22orf31O95567 290 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 MYL3P08590 195 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 PPP1R7Q15435 360 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 SETD4Q9NVD3 440 aa21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
KCNS3-201ENST00000304101 PSTPIP1O43586 416 aa21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 LSP1P33241 339 aa21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 A6NJR5 290 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PGK1P00558 417 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MYL6P60660 151 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TFDP1Q14186 410 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 DENND2CQ68D51 928 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 KAT2BQ92831 832 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PARVAQ9NVD7 372 aa21.76■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MAN1A1P33908 653 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 ODF2Q5BJF6 829 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 HOOK3Q86VS8 718 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 ART4Q93070 314 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 ACKR2O00590 384 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 VTNP04004 478 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CYBAP13498 195 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PROZP22891 400 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CCT5P48643 541 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CALCOCO2Q13137 446 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TRPC3Q13507 836 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MMP8P22894 467 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 KRT17Q04695 432 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 HIC1Q14526 733 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SLMAPQ14BN4 828 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 GRIK4Q16099 956 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 FZD8Q9H461 694 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CISHQ9NSE2 258 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 AKR1A1P14550 325 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CD58P19256 250 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 CHST7Q9NS84 486 aa21.74■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 EBAG9O00559 213 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 NDUFAB1O14561 156 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SNX1Q13596 522 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 EPN3Q9H201 632 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 GPR25O00155 361 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 TULP2O00295 520 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 SHBGP04278 402 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 MAP2K2P36507 400 aa21.73■■□□□ 1.07
KCNS3-201ENST00000304101 PPP2R2AP63151 447 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms