RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 DNA2P51530 1060 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TNNC1P63316 161 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 HES6Q96HZ4 224 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 GAD1Q99259 594 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP85Q9BW27 656 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 EHD2Q9NZN4 543 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CAND2O75155 1236 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF4AO95239 1232 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CD4P01730 458 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP3A5P20815 502 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 NDST1P52848 882 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD6Q96KE9 485 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB118Q96PH6 123 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 EPC1Q9H2F5 836 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0U1RQF3 1178 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD13C9JR72 458 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 DNM1LO00429 736 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF623O75123 536 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGA4P13612 1032 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP8P22894 467 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX26Q7Z412 305 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A14Q96JA4 679 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM7Q9C029 511 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 SQORQ9Y6N5 450 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL5CA6NH57 179 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM2Q99965 735 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG6Q9Y672 507 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CD19P15391 556 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LRPAP1P30533 357 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KA1Q15418 735 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 USP38Q8NB14 1042 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD7Q92527 254 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 KPNA7A9QM74 516 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 HCRTO43612 131 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAGE8P0CG41 777 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRA4P59901 499 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 GPNMBQ14956 572 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 UBXN4Q92575 508 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LHX5Q9H2C1 402 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 O00370 1275 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MYBL1P10243 752 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL5P13501 91 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf29Q8N999 325 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF208Q9H0X6 261 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK3O14649 394 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 FGFR1P11362 822 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MAMLD1Q13495 774 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 MESDQ14696 234 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX35Q5T0J7 233 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms