RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277632.7

MINDY3-201, Transcript of MINDY lysine 48 deubiquitinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MINDY3, Length 2,381 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3-201ENST00000277632 SORBS3O60504 671 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CCDC22O60826 627 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 GAS7O60861 476 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ZWINTO95229 277 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 SETSIPP0DME0 302 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 FDX1P10109 184 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CYP2C8P10632 490 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 MUTP22033 750 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 OAZ1P54368 228 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ADCY1Q08828 1119 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 STAT4Q14765 748 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CCNJLQ8IV13 435 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 DYDC2Q96IM9 177 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ACAD9Q9H845 621 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CAPN9O14815 690 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 COQ9O75208 318 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 KRT36O76013 467 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 RGS20O76081 388 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PSMG1O95456 288 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PYGMP11217 842 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CETPP11597 493 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 COMTP21964 271 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 PDK4Q16654 411 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ARSHQ5FYA8 562 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 RASIP1Q5U651 963 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 LCA5Q86VQ0 697 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 STMN2Q93045 179 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 MIPEPQ99797 713 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 SYNCQ9H7C4 482 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 TMCO1Q9UM00 188 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 MYPNQ86TC9 1320 aa9.9□□□□□ -0.82
MINDY3-201ENST00000277632 C2CD2LO14523 706 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SLITRK3O94933 977 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 RPA1P27694 616 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 HOXD13P35453 343 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 CASP4P49662 377 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SLC18A1P54219 525 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SLC12A3P55017 1021 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 TMED2Q15363 201 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 CST9Q5W186 159 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 ZNF398Q8TD17 642 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 EURLQ9NYK6 297 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 NR3C2P08235 984 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MAN1A1P33908 653 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MAGEA8P43361 318 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 ITGA8P53708 1063 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 GPC5P78333 572 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MCL1Q07820 350 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 PPP2R5CQ13362 524 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MTMR1Q13613 665 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 PTK6Q13882 451 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MESDQ14696 234 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 KIF22Q14807 665 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 FYB2Q5VWT5 728 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SFR1Q86XK3 245 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 PALB2Q86YC2 1186 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 TPH2Q8IWU9 490 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.89□□□□□ -0.83
MINDY3-201ENST00000277632 SPOCK2Q92563 424 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms