RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP8P40818 1118 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR1G1P47890 313 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUL2Q13617 745 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPRED2Q7Z698 418 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HASPINQ8TF76 798 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NENFQ9UMX5 172 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP8B3O60423 1300 aa21.76■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC11A1P49279 550 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYL6P60660 151 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UPP1Q16831 310 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FIBCD1Q8N539 461 aa21.75■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFR2Q9UP52 801 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANO9A1A5B4 782 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.075e-17■■■■□ 19.4
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF4BQ92750 862 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGPAT1Q99943 283 aa21.75■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIRO00625 290 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRP1O14786 923 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP26A1O43174 497 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLSTN1O94985 981 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CA3P07451 260 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALTP07902 379 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFAIP3P21580 790 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCAR1P56945 870 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR24Q96S15 920 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPTLC1O15269 473 aa21.73■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.73■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCN1AP35498 2009 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALDH2P05091 517 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT5P13647 590 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF699Q32M78 642 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARCH5Q9NX47 278 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP11B1P15538 503 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATICP31939 592 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRCC3P46736 316 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.71■■□□□ 1.07
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