RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.1■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PIK3CDO00329 1044 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ASNSP08243 561 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GSTT2P0CG29 244 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 GSTT2BP0CG30 244 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 IL9RQ01113 521 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 JAMLQ86YT9 394 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MATN2O00339 956 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 EXOC3O60645 756 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CDC16Q13042 620 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 KIF22Q14807 665 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 C16orf87Q6PH81 154 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 C10orf82Q8WW14 230 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 HSPBAP1Q96EW2 488 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PFASO15067 1338 aa23.09■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 MSH4O15457 936 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CIITAP33076 1130 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CA8P35219 290 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R5CQ13362 524 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 INAQ16352 499 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CCDC153Q494R4 210 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 CGREF1Q99674 301 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.08■■□□□ 1.29
PITX1-201ENST00000265340 ZNF862O60290 1169 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FGGP02679 453 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LONRF1Q17RB8 773 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SCAIQ8N9R8 606 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.08■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SCN4AP35499 1836 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NDUFB5O43674 189 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RELAQ04206 551 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LRRC41Q15345 812 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NEPROQ6NW34 567 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 POTEGQ6S5H5 508 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CEP70Q8NHQ1 597 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ITPKCQ96DU7 683 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 F8W8V4 182 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 AP1G1O43747 822 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ANPEPP15144 967 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NFKBIAP25963 317 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RAB15P59190 212 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 UBXN2AP68543 259 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MAPK7Q13164 816 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SMUG1Q53HV7 270 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CENPPQ6IPU0 288 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 HES6Q96HZ4 224 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 STK33Q9BYT3 514 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.07■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NR2E1Q9Y466 385 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 WDR90Q96KV7 1748 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ATP8B3O60423 1300 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CYP3A4P08684 503 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G4BP0C869 781 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 TRPC1P48995 793 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PSMC6P62333 389 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MED21Q13503 144 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms