RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FZD5Q13467 585 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A14Q15043 492 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SHISA7A6NL88 538 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 GCNT3O95395 438 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 IDEP14735 1019 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 STAT6P42226 847 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FOXK2Q01167 660 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ALCAMQ13740 583 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SV2CQ496J9 727 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FAM3CQ92520 227 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PANK2Q9BZ23 570 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 KPNA7A9QM74 516 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 CHADO15335 359 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 GARTP22102 1010 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 GABRR2P28476 465 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PNPLA4P41247 253 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ID4P47928 161 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 KCNA1Q09470 495 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 VEPH1Q14D04 833 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 GAREM2Q75VX8 874 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 RUBCNQ92622 972 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF560Q96MR9 790 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 USP28Q96RU2 1077 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 HINFPQ9BQA5 517 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 IER2Q9BTL4 223 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR6Q9Y217 621 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PATJQ8NI35 1801 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TCHHQ07283 1943 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 DPYSL4O14531 572 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SOAT2O75908 522 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TAF12Q16514 161 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 WSCD1Q658N2 575 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MSANTD3Q96H12 275 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM206Q9H813 350 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 PANK4Q9NVE7 773 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 MTAPQ13126 283 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 GPR158Q5T848 1215 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 CHRDQ9H2X0 955 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 OBP2AQ9NY56 170 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.7■■□□□ 1.23
NEDD8-201ENST00000250495 ARNTLO00327 626 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 STX6O43752 255 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 WEE1P30291 646 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CDC25CP30307 473 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2R5DQ14738 602 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NELL1Q92832 810 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SAAL1Q96ER3 474 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GCNAQ96QF7 691 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TASP1Q9H6P5 420 aa22.7■■□□□ 1.22
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