RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 CYLDQ9NQC7 956 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 T-ENOLP0DO92 83 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 GNAZP19086 355 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 GPS1Q13098 491 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM270Q6UE05 265 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC1A5Q15758 541 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 GMLQ99445 158 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 HAO1Q9UJM8 370 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRJQ12913 1337 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 E7ENQ6 273 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 LPAR1Q92633 364 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.37■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ETS1P14921 441 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 CA4P22748 312 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 LIG4P49917 911 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KAZNQ674X7 775 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPUQ71F23 418 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 FETUBQ9UGM5 382 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT1P04264 644 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TCF4P15884 667 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 CALB2P22676 271 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP8P22894 467 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 EFHC2Q5JST6 749 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRX1Q86UT6 975 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM83AQ86UY5 434 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNN1Q92952 543 aa23.36■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX11AO75192 247 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGAVP06756 1048 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM13CQ8NE31 585 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PSME4Q14997 1843 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED4O75132 1171 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RASSF2P50749 326 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF398Q8TD17 642 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRASP2Q96D09 838 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PPM1 405 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP2A1O14983 1001 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 HHATQ5VTY9 493 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC42Q9Y546 428 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.35■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ARID2Q68CP9 1835 aa23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZWINTO95229 277 aa23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.34■■□□□ 1.33
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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