RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CLGN	O14967	610 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SNX2	O60749	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NAMPT	P43490	491 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ITGB3	P05106	788 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DRC3	Q9H069	523 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	WHRN	Q9P202	907 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HBP1	O60381	514 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PDHA1	P08559	390 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PGM5	Q15124	567 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PAK5	Q9P286	719 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NFIB	O00712	420 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CST8	O60676	142 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NPTXR	O95502	500 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GRIK1	P39086	918 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CD4	P01730	458 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GLI1	P08151	1106 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GART	P22102	1010 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MEA1	Q16626	185 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLITRK3	O94933	977 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	POLE2	P56282	527 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SV2C	Q496J9	727 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	EPAS1	Q99814	870 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CES2	O00748	559 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SERPINB9	P50453	376 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SMAP	O00193	183 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CUL3	Q13618	768 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RBBP7	Q16576	425 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	VCAM1	P19320	739 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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