RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-210	ENST00000580799	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DUSP4	Q13115	394 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	BICD1	Q96G01	975 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	NCAN	O14594	1321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TSC2	P49815	1807 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	OGT	O15294	1046 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SLC26A4	O43511	780 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ADRB2	P07550	413 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ODC1	P11926	461 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	WEE1	P30291	646 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ABCD1	P33897	745 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LIG4	P49917	911 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SATB1	Q01826	763 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CD302	Q8IX05	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DPYSL4	O14531	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	FAM189A1	O60320	539 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SEC24B	O95487	1268 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PIGR	P01833	764 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	HOXA6	P31267	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TNFSF9	P41273	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LILRA4	P59901	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SPAG1	Q07617	926 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	GAS6	Q14393	721 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CSRP2	Q16527	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SPATA1	Q5VX52	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	AK8	Q96MA6	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TBX20	Q9UMR3	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	F5	P12259	2224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799		A0A0B4J269	797 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SLC30A4	O14863	429 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	GABRR2	P28476	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CTH	P32929	405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	LPAL2	Q16609	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-210	ENST00000580799	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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