RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL2O95198 593 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GRAP2O75791 330 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PDHBP11177 359 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CRYMQ14894 314 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DRAP01903 254 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ANKS1AQ92625 1134 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PAK5Q9P286 719 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 AIM2O14862 343 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TEKT4Q8WW24 435 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF197O14709 1029 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ1P48048 391 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 UGP2Q16851 508 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 EME1Q96AY2 570 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN1Q05586 938 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NYAP2Q9P242 653 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RAD51Q06609 339 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RRM2BQ7LG56 351 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA18Q8TC71 538 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CYGBQ8WWM9 190 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 B2RBV5 119 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KCNQ2O43526 872 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PDGFRBP09619 1106 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 DMC1Q14565 340 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KIZQ2M2Z5 673 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPAG6O75602 509 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 WDR47O94967 919 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RASA1P20936 1047 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SLC29A2Q14542 456 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MADDQ8WXG6 1647 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY3O60266 1144 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 POTEAQ6S8J7 498 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HIC2Q96JB3 615 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FAM107AO95990 144 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HSD17B3P37058 310 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FBXW4P57775 412 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KRT35Q92764 455 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K10Q02779 954 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MFN1Q8IWA4 741 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MDM1Q8TC05 714 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RSAD1Q9HA92 442 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NOD2Q9HC29 1040 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G4AP47712 749 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MTM1Q13496 603 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PLD3Q8IV08 490 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 IL25Q9H293 177 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 COG2Q14746 738 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CSF1RP07333 972 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 VCAM1P19320 739 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2H1P32780 548 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRKCEQ02156 737 aa22.3■■□□□ 1.16
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