RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31D3P0C874 917 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR1D2P34982 312 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENPEPQ07075 957 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC1BQ9P126 229 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 COG5Q9UP83 839 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D4O60343 1298 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 OAZ2O95190 189 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TYMPP19971 482 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCOA4Q13772 614 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 WSCD1Q658N2 575 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF280DQ6N043 979 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TGM5O43548 720 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 HUS1O60921 280 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLUD1P00367 558 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP11A1P05108 521 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARPP19P56211 112 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLUL1Q15846 466 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASP10Q92851 521 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 THEGQ9P2T0 379 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSEQ9UL01 958 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 L1RE1Q9UN81 338 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 METTL23Q86XA0 190 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLSTN1O94985 981 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 HLA-DRAP01903 254 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2H1P32780 548 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3CAP42336 1068 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB33AQ14088 237 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 LILRA6Q6PI73 481 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC35C1Q96A29 364 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.193e-10■■■■■ 57.7
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO10Q9NW15 660 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 STX10O60499 249 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNA14O95837 355 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATICP31939 592 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ROR1Q01973 937 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 STX1AQ16623 288 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF699Q32M78 642 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMS19Q96T76 1030 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOL5Q9BWW9 433 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR4Q2P0C623 313 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBWD6Q4V339 395 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT39Q6A163 491 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM209Q96SK2 561 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLIQ9UNA4 740 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR27A2RRH5 827 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRN2O75325 713 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MXI1P50539 228 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNNC1P63316 161 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TYRO3Q06418 890 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR6C75A6NL08 312 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC192P0DO97 292 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms