RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	MOSPD3	O75425	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	EBLN1	P0CF75	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NR2F6	P10588	404 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	MPG	P29372	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NPTX2	P47972	431 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF365	Q70YC5	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TMIE	Q8NEW7	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	RFK	Q969G6	155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.05	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843		E7ENX8	843 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CERS1	P27544	350 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TAP2	Q03519	686 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	PIGF	Q07326	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	FHL1	Q13642	323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	BRINP1	O60477	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NTN1	O95631	604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	RSPH3	Q86UC2	560 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TDP1	Q9NUW8	608 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	INTU	Q9ULD6	942 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843		A0A0B4J269	797 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ENPP3	O14638	875 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLC43A1	O75387	559 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PRKD3	O94806	890 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CD1A	P06126	327 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	AGXT	P21549	392 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	FAP	Q12884	760 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TUBB3	Q13509	450 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	STAT4	Q14765	748 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	FKBP10	Q96AY3	582 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	RGMA	Q96B86	450 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TRIB1	Q96RU8	372 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843		E9PLN8	166 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PPP6C	O00743	305 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PCSK6	P29122	969 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SOX5	P35711	763 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	WAS	P42768	502 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CDC42EP1	Q00587	391 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	KLHL22	Q53GT1	634 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CEP85	Q6P2H3	762 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SMO	Q99835	787 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	EHD3	Q9NZN3	535 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	DKK3	Q9UBP4	350 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	TISP43	B9A030	160 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843		F5H697	171 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2D6	P10635	497 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	NDUFV1	P49821	464 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	GYS2	P54840	703 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	CEP78	Q5JTW2	689 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	PPM1N	Q8N819	430 aa		5	□□□□□ -1.61
COPS2-205	ENST00000558843	POC1B	Q8TC44	478 aa		5	□□□□□ -1.61

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