RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557821.5

PLCB2-204, Transcript of phospholipase C beta 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLCB2, Length 4,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2-204ENST00000557821 SENP1Q9P0U3 644 aa20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ZNF384Q8TF68 577 aa20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SIK2Q9H0K1 926 aa20.51■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CYTH2Q99418 400 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SH3BP5O60239 455 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PID1Q7Z2X4 250 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 APPL2Q8NEU8 664 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 TATDN2Q93075 761 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MTM1Q13496 603 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 KIF3CO14782 793 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PJA2O43164 708 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CENPCQ03188 943 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SPATA18Q8TC71 538 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CGRRF1Q99675 332 aa20.5■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PIK3CDO00329 1044 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CYP2B6P20813 491 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 COG7P83436 770 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CBWD6Q4V339 395 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 WDR18Q9BV38 432 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 DONSONQ9NYP3 566 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PDHA1P08559 390 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 NUF2Q9BZD4 464 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 VPS33BQ9H267 617 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 GOLGA8RI6L899 631 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MAGEA4P43358 317 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 VPS39Q96JC1 886 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MAP3K7O43318 606 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CTSHP09668 335 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CETPP11597 493 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 TISP43B9A030 160 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ITGA4P13612 1032 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 METTL7BQ6UX53 244 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 DNERQ8NFT8 737 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 USP20Q9Y2K6 914 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SNHG28P0DPA3 235 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 DIAPH2O60879 1101 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 RSAD1Q9HA92 442 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 STOML1Q9UBI4 398 aa20.48■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 HSPA4LO95757 839 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 KCNMA1Q12791 1236 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 DGKDQ16760 1214 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CREG2Q8IUH2 290 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ORC1Q13415 861 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PLCB2-204ENST00000557821 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms