RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 DSEQ9UL01 958 aa23.5■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 A0A087X0B3 334 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ANO9A1A5B4 782 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SPTLC2O15270 562 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TAF6P49848 677 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ALCAMQ13740 583 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 FAM78AQ5JUQ0 283 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 STRA6Q9BX79 667 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.49■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CYB561D2O14569 222 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 GJA1P17302 382 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CASP5P51878 434 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 HSCBQ8IWL3 235 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SAAL1Q96ER3 474 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ASB16Q96NS5 453 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TMEM209Q96SK2 561 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.48■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 NOTCH4Q99466 2003 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 MTMR11A4FU01 709 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 VNN2O95498 520 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CYP11A1P05108 521 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 GRM2Q14416 872 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TEAD2Q15562 447 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CENPPQ6IPU0 288 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 POTEHQ6S545 545 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SMARCD2Q92925 531 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 BCO2Q9BYV7 579 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CRISPLD1Q9H336 500 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 BRD9Q9H8M2 597 aa23.47■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 FAM170BA6NMN3 283 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 LRRN2O75325 713 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CD72P21854 359 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 EPHA5P54756 1037 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SV2CQ496J9 727 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SNX21Q969T3 373 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 ZNF560Q96MR9 790 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 GPR88Q9GZN0 384 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 TMEM206Q9H813 350 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.46■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.45■■□□□ 1.35
CIPC-208ENST00000557115 A0A1W2PRU2 124 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 PRR23AA6NEV1 266 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 KPNA7A9QM74 516 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 PPP6R2O75170 966 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 GARTP22102 1010 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 FCARP24071 287 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 PNPLA4P41247 253 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 CDR1P51861 262 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 WSCD1Q658N2 575 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 ITIH5Q86UX2 942 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 DHX58Q96C10 678 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 TNMDQ9H2S6 317 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 ASB3Q9Y575 518 aa23.45■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 MOSPD3O75425 235 aa23.44■■□□□ 1.34
CIPC-208ENST00000557115 SOAT2O75908 522 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms