RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 FZD8Q9H461 694 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 INTUQ9ULD6 942 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 CLDN3O15551 220 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 TREHO43280 583 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 KIF4AO95239 1232 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 DRD4P21917 467 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 SV2AQ7L0J3 742 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.52■■□□□ 1.04
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TSTA3-214ENST00000531473 KCNN1Q92952 543 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 CFAP73A6NFT4 308 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 MAPK13O15264 365 aa21.52■■□□□ 1.04
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TSTA3-214ENST00000531473 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 AMHR2Q16671 573 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-214ENST00000531473 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 MAGEB2O15479 319 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 ECHS1P30084 290 aa21.51■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 PBKQ96KB5 322 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 TOM1L1O75674 476 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 GPC3P51654 580 aa21.51■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.51■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 COL1A2P08123 1366 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ACKR2O00590 384 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 ITIH4Q14624 930 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.5■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 HAS3O00219 553 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 TRADDQ15628 312 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 ZPBP2Q6X784 338 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 GPR25O00155 361 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ASAP2O43150 1006 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 PROZP22891 400 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 PPP1R7Q15435 360 aa21.49■■□□□ 1.03
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TSTA3-214ENST00000531473 CCDC63Q8NA47 563 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 C15orf41Q9Y2V0 281 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 CEP104O60308 925 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 GALCP54803 685 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ADAM17P78536 824 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-214ENST00000531473 KRT39Q6A163 491 aa21.48■■□□□ 1.03
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