RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 GPR17Q13304 367 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TMC8Q8IU68 726 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FAM212AQ96EL1 285 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MTMR11A4FU01 709 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 STX6O43752 255 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CYP11A1P05108 521 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MYBPC2Q14324 1141 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 BORCS6Q96GS4 357 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ASB16Q96NS5 453 aa20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 STK25O00506 426 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ODC1P11926 461 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 GAP43P17677 238 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PRKCQQ04759 706 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DUSP4Q13115 394 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CENPPQ6IPU0 288 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SV2BQ7L1I2 683 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.4■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZNF197O14709 1029 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GJA1P17302 382 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 RFX1P22670 979 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TXLNAP40222 546 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PFKPQ01813 784 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 E2F4Q16254 413 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 USP37Q86T82 979 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 LEMD2Q8NC56 503 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SHDQ96IW2 340 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ASAH2Q9NR71 780 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PTPRDP23468 1912 aa20.39■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PAX3P23760 479 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 STAT6P42226 847 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 IQCEQ6IPM2 695 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 VITQ6UXI7 678 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ELMOD1Q8N336 334 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CXorf38Q8TB03 319 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SMARCD2Q92925 531 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 FAM84AQ96KN4 292 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PANK2Q9BZ23 570 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 DPP3Q9NY33 737 aa20.38■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SOAT2O75908 522 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GCNT3O95395 438 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 MYL4P12829 197 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CD72P21854 359 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GRM2Q14416 872 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TEAD2Q15562 447 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 DNASE1L2Q92874 299 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SNX21Q969T3 373 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ACCSQ96QU6 501 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.37■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ARNTLO00327 626 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TAF6P49848 677 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 619.1 ms