RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526001.1

CSF1-208, Transcript of colony stimulating factor 1, human

TSL 4

Gene CSF1, Length 573 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSF1-208	ENST00000526001	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CYB561D2	O14569	222 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ECI2	O75521	394 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SOAT2	O75908	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CYP11A1	P05108	521 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MYL4	P12829	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	RFX1	P22670	979 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	FCAR	P24071	287 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TAF6	P49848	677 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	GPR17	Q13304	367 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ANK1	P16157	1881 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ZNF197	O14709	1029 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	LRRN2	O75325	713 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	IL18RAP	O95256	599 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	GART	P22102	1010 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CASP1	P29466	404 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	HOXD13	P35453	343 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	EPHA5	P54756	1037 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ALCAM	Q13740	583 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	GRM2	Q14416	872 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TSC2	P49815	1807 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	NCAN	O14594	1321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	EXTL3	O43909	919 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MICAL2	O94851	1124 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ITGB3	P05106	788 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PAX3	P23760	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	STARD6	P59095	220 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ASIC1	P78348	528 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TEAD2	Q15562	447 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	DSE	Q9UL01	958 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CSF1-208	ENST00000526001	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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