RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MSCO60682 206 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TMCC1O94876 653 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ASLP04424 464 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 AKR1A1P14550 325 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MTFR1Q15390 333 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CENPPQ6IPU0 288 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 AADACL2Q6P093 401 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 C4orf50Q6ZRC1 276 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 VTA1Q9NP79 307 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 OR52Z1P0C646 297 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 C18orf8Q96DM3 657 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 GMEB1Q9Y692 573 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PALB2Q86YC2 1186 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 TPH2Q8IWU9 490 aa10.68□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.68□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
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TRPS1-211ENST00000520276 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 M0QZ92 97 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 INHAP05111 366 aa10.67□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ACTN1P12814 892 aa10.67□□□□□ -0.7
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