RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 SOAT2O75908 522 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 IL18RAPO95256 599 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PTPN5P54829 565 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ALCAMQ13740 583 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 RESP18Q5W5W9 173 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 IQUBQ8NA54 791 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 NXPE3Q969Y0 559 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CUEDC2Q9H467 287 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 WNT16Q9UBV4 365 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PIEZO1Q92508 2521 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MTMR11A4FU01 709 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 OR6C75A6NL08 312 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 H0Y858 1186 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CYB561D2O14569 222 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MOSPD3O75425 235 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GJA1P17302 382 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GARTP22102 1010 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TAF6P49848 677 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GPC5P78333 572 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 DUSP4Q13115 394 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GPR17Q13304 367 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 BORCS6Q96GS4 357 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CACNA1HO95180 2353 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PTPRJQ12913 1337 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 EXTL3O43909 919 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ITGB3P05106 788 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CYP11A1P05108 521 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MYL4P12829 197 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 AOC1P19801 751 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 AFMP43652 599 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CLCN5P51795 746 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 WSCD1Q658N2 575 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CENPPQ6IPU0 288 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MTSS1LQ765P7 747 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CXorf38Q8TB03 319 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PRRX2Q99811 253 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM206Q9H813 350 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 KPNA7A9QM74 516 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 FCARP24071 287 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MRE11P49959 708 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 EHHADHQ08426 723 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CUL4BQ13620 913 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MYBPC2Q14324 1141 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TANGO2Q6ICL3 276 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GPD1LQ8N335 351 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC3Q9BY71 257 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 GDE1Q9NZC3 331 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 MAFFQ9ULX9 164 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 STK25O00506 426 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TGFB1I1O43294 461 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 EPHA5P54756 1037 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 AMPD3Q01432 767 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TEAD2Q15562 447 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 SV2CQ496J9 727 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ATL3Q6DD88 541 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 IQCEQ6IPM2 695 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 UNC13DQ70J99 1090 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 TMC8Q8IU68 726 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-211ENST00000506932 ELMOD1Q8N336 334 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.4 ms