RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 J3QL48 77 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PSMD10O75832 226 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 OATP04181 439 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RHOP08100 348 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SKIP12755 728 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CCR2P41597 374 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 OR1G1P47890 313 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PRKCEQ02156 737 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 BECN1Q14457 450 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 UGCGQ16739 394 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 USP41Q3LFD5 358 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PMS2CLQ68D20 193 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FUT10Q6P4F1 479 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PDXDC1Q6P996 788 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 HAS1Q92839 578 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SLC5A5Q92911 643 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MSANTD3Q96H12 275 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FAM167AQ96KS9 214 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RSAD1Q9HA92 442 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PTPRDP23468 1912 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RELNP78509 3460 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WZ62 844 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 WDR27A2RRH5 827 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM150BA6NC51 233 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 WDR64B1ANS9 1081 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CHMP2AO43633 222 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 XYLBO75191 536 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RHOBTB1O94844 696 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ATP2B1P20020 1258 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CTHP32929 405 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 VIPR2P41587 438 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TRAPPC10P48553 1259 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 UVSSAQ2YD98 709 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TTC38Q5R3I4 469 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 URGCPQ8TCY9 931 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 HPS1Q92902 700 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CHFRQ96EP1 664 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MTMR9Q96QG7 549 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CEP89Q96ST8 783 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 FZD8Q9H461 694 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 DISC1Q9NRI5 854 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 POLIQ9UNA4 740 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TSC2P49815 1807 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TBX3O15119 743 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 NEMFO60524 1076 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MICAL2O94851 1124 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CD59P13987 128 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ITPKBP27987 946 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MCM7P33993 719 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RAB27AP51159 221 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CFHR1Q03591 330 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 RAB33AQ14088 237 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 PON2Q15165 354 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF174Q15697 407 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 ELF2Q15723 593 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 MTERF2Q49AM1 385 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms