RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491658.1

TFRC-215, Transcript of transferrin receptor, human

TSL 5

Gene TFRC, Length 396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFRC-215	ENST00000491658	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658		Q6ZNX1	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SMO	Q99835	787 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CDH19	Q9H159	772 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658		E7ENX8	843 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	OFD1	O75665	1012 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CHEK2	O96017	543 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ALDH2	P05091	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	RARB	P10826	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PHKA1	P46020	1223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TAP2	Q03519	686 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	FPGS	Q05932	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TOR1B	O14657	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	RFPL1	O75677	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SRGN	P10124	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	BMP5	P22003	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PLA2G5	P39877	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	IL12RB1	P42701	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PLS1	Q14651	629 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SNX19	Q92543	992 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658		H3BUI4	141 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PROM1	O43490	865 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	AP1G1	O43747	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	AHSG	P02765	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	GATA3	P23771	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TCF15	Q12870	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	PRR16	Q569H4	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TFRC-215	ENST00000491658	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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