RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486223.1

FREM1-208, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix 1, human

TSL 3

Gene FREM1, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FREM1-208	ENST00000486223	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	TLE1	Q04724	770 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	FPGS	Q05932	587 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FREM1-208	ENST00000486223	NDUFS2	O75306	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	PRKCG	P05129	697 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	JUP	P14923	745 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	GPD1	P21695	349 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	FAP	Q12884	760 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	HSD3B2	P26439	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	DSC2	Q02487	901 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CREM	Q03060	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	KAT5	Q92993	513 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	REPS1	Q96D71	796 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF213	O14771	459 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CD1A	P06126	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	F2RL2	O00254	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SGTA	O43765	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	DRD4	P21917	467 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SOX10	P56693	466 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FREM1-208	ENST00000486223	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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