RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC15A4Q8N697 577 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 AFG1LQ8WV93 481 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 USP40Q9NVE5 1235 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 AASSQ9UDR5 926 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TMCC2O75069 709 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL18O94889 574 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TGFB1P01137 390 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SBK3P0C264 359 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 JUPP14923 745 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 NPPBP16860 134 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 EGR1P18146 543 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PTMSP20962 102 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH1A3P47895 512 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC11A2P49281 568 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF7P61962 342 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CUL4BQ13620 913 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DLGAP5Q15398 846 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC14AQ86T13 490 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CFHR4Q92496 578 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SPSB4Q96A44 273 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF32Q9H0A6 362 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RLIMQ9NVW2 624 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ING3Q9NXR8 418 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 JAG2Q9Y219 1238 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087X0M5 115 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GX30 115 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 FSD2A1L4K1 749 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO1CO00159 1063 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT10BO00744 389 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 WIPF1O43516 503 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNQ3O43525 872 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB5O75953 348 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTL6BO94805 426 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GJB1P08034 283 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RARBP10826 455 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GYS1P13807 737 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD52P43351 418 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PNLIPRP1P54315 467 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKAA2P54646 552 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 UCP3P55916 312 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MXRA7P84157 204 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE3AQ05086 875 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PLCL1Q15111 1095 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPYL6Q8N831 410 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 MDM1Q8TC05 714 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 COG8Q96MW5 612 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 WRNIP1Q96S55 665 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 VWA7Q9Y334 891 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 INMTO95050 263 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 GRPP07492 148 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 RAP2AP10114 183 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2C8P10632 490 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 ACVR2AP27037 513 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNQ1P51787 676 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC24CP53992 1094 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-209ENST00000473406 AP2B1P63010 937 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms