RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TTC27Q6P3X3 843 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB33Q86T24 672 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PRELID2Q8N945 189 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TFAP2BQ92481 460 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF653Q96CK0 615 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM11Q96F44 468 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP4Q96MN2 994 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 KRT12Q99456 494 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NUP85Q9BW27 656 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ASB7Q9H672 318 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RRAGCQ9HB90 399 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CISHQ9NSE2 258 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TSC2P49815 1807 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 LACTBL1A8MY62 500 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 H0YGN5 161 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CILPO75339 1184 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 FGGP02679 453 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 VTNP04004 478 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 STAG3L1P0CL83 205 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PYGMP11217 842 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 KRT5P13647 590 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA6P17066 643 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 GNA15P30679 374 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 USP8P40818 1118 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RAD23BP54727 409 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PPFIA1Q13136 1202 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PAK2Q13177 524 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 BIRC3Q13489 604 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MAMLD1Q13495 774 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CUL1Q13616 776 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD10Q14728 455 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CLUL1Q15846 466 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 DGKDQ16760 1214 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 KYAT1Q16773 422 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PTPROQ16827 1216 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MAP9Q49MG5 647 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 EMC10Q5UCC4 262 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NAA35Q5VZE5 725 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 AADACL2Q6P093 401 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM270Q6UE05 265 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 CD302Q8IX05 232 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 IFT20Q8IY31 132 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD6Q96KE9 485 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TWNKQ96RR1 684 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 LHX5Q9H2C1 402 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MED4Q9NPJ6 270 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 WBP1LQ9NX94 342 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CPA4Q9UI42 421 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 POLIQ9UNA4 740 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DERAQ9Y315 318 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 Q9Y3F1 56 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 C2CD2Q9Y426 696 aa6.02□□□□□ -1.45
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