RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TBCBQ99426 244 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMD1Q99460 953 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-205ENST00000462042 RASA4BC9J798 803 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 LEFTY2O00292 366 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 RASA4O43374 803 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 IL18RAPO95256 599 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CASP5P51878 434 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CTSWP56202 376 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC13A2Q13183 592 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 FBLN7Q53RD9 439 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 C20orf173Q96LM9 149 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SERHLQ9NQF3 203 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB5O75953 348 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC5CO95185 931 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 GRPP07492 148 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP2C9P11712 490 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SRLQ86TD4 932 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 MORC1Q86VD1 984 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PDPRQ8NCN5 879 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 KLC2Q9H0B6 622 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF181Q9P0P0 153 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMX2Q9Y320 296 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087WWL8 130 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 M0QYG6 137 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SOAT2O75908 522 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 FCER1AP12319 257 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 VIPR2P41587 438 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 SATB1Q01826 763 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF543Q08ER8 600 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 RABL3Q5HYI8 236 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CDYLQ9Y232 598 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 E7ENX8 843 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGGTB-205ENST00000462042 PRSS23O95084 383 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-DOAP06340 250 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 STT3AP46977 705 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC11A2P49281 568 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 TAP2Q03519 686 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.8□□□□□ -1.32
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