RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLDND1Q9NY35 253 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBX20Q9UMR3 447 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 NENFQ9UMX5 172 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP20Q9Y2K6 914 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND3A2RUS2 1198 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC16A4O15374 487 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 MBTPS2O43462 519 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP104O60308 925 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF40O75150 1001 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRN2O75325 713 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT37O76014 449 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL10P02778 98 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GZMAP12544 262 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RFC5P40937 340 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ID4P47928 161 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIG4P49917 911 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNA2P51530 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GALCP54803 685 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 BPIFB4P59827 614 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRKCEQ02156 737 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCEAL1Q15170 157 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPROQ16827 1216 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBWD6Q4V339 395 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPC2Q52LR7 807 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP58Q5T655 872 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CROCCP2Q86T23 111 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPAINQ86UA6 219 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF677Q86XU0 584 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAW1Q8N136 415 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 MREGQ8N565 214 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 FNBP1Q96RU3 617 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT12Q99456 494 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGPAT1Q99943 283 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMYND15Q9H091 742 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 VTA1Q9NP79 307 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PARP2Q9UGN5 583 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL4A6Q14031 1691 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 CACNA1BQ00975 2339 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM186AA6NE01 2351 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR23AA6NEV1 266 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF233A6NK53 670 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0Y858 1186 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BNC9 293 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRIT1O00522 736 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBNO60934 754 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTN2O75298 545 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGS20O76081 388 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 OATP04181 439 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYBL1P10243 752 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNA2P16389 499 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 ICAM3P32942 547 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP8P40818 1118 aa6.74□□□□□ -1.33
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