RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 PTPN7P35236 360 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 BHMTQ93088 406 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CTSHP09668 335 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 TRADDQ15628 312 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 REEP2Q9BRK0 252 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PIF1Q9H611 641 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 WASHC5Q12768 1159 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CENPPQ6IPU0 288 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 BARGINQ6ZT62 677 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CARD9Q9H257 536 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MAP3K6O95382 1288 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MMP10P09238 476 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 COMTP21964 271 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RFX3P48380 749 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 KCNK10P57789 538 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DEFA1P59665 94 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DEFA3P59666 94 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 JAMLQ86YT9 394 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 FAM136AQ96C01 138 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NSL1Q96IY1 281 aa16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ITIH2P19823 946 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SPATA18Q8TC71 538 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 HAO1Q9UJM8 370 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 USP1O94782 785 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 LUZP2Q86TE4 346 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 P3H2Q8IVL5 708 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 KCNB2Q92953 911 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SYNMO15061 1565 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DSG1Q02413 1049 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GID8Q9NWU2 228 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 KLHL2O95198 593 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RAD51Q06609 339 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GLMNQ92990 594 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 H7C1W4 665 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RARBP10826 455 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ALFQ53S48 1182 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.36■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 UPP2O95045 317 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SH3GL1Q99961 368 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CDH16O75309 829 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 ALBP02768 609 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NCOA4Q13772 614 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 SLC29A2Q14542 456 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 STK33Q9BYT3 514 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NOD2Q9HC29 1040 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 DDHD2O94830 711 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 UCHL3P15374 230 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 FMO5P49326 533 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 TRIM16LQ309B1 348 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 POTEAQ6S8J7 498 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 FOPNLQ96NB1 174 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 CD209Q9NNX6 404 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 NCALDP61601 193 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 GALNTL6Q49A17 601 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 E2F7Q96AV8 911 aa16.35■□□□□ 0.21
DYSF-211ENST00000429174 MASTLQ96GX5 879 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms