RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 CDH7Q9ULB5 785 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ANK1P16157 1881 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PTPRJQ12913 1337 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF233A6NK53 670 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OR6C75A6NL08 312 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KPNA7A9QM74 516 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CYB561D2O14569 222 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CLIC2O15247 247 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NARSO43776 548 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 XYLBO75191 536 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RHOP08100 348 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ELF1P32519 619 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TAF6P49848 677 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MYBPC2Q14324 1141 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PRSS36Q5K4E3 855 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 WSCD1Q658N2 575 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CENPPQ6IPU0 288 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM174Q8WUU8 243 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRC3Q9BY71 257 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 INTS13Q9NVM9 706 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DMAC2Q9NW81 257 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP72Q9P209 647 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 INSL5Q9Y5Q6 135 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 WDFY4Q6ZS81 3184 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MOSPD3O75425 235 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ITGB3P05106 788 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PRR29P0C7W0 189 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ODC1P11926 461 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NPR3P17342 541 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PTPN2P17706 415 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CCR2P41597 374 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SYKP43405 635 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TWF1Q12792 350 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DUSP4Q13115 394 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PSMD2Q13200 908 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 HTR4Q13639 388 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 BECN1Q14457 450 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 IER5LQ5T953 404 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PARM1Q6UWI2 310 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LIMS2Q7Z4I7 341 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 USP37Q86T82 979 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FBXL6Q8N531 539 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RDH13Q8NBN7 331 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF516Q92618 1163 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FGF14Q92915 247 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NXPE3Q969Y0 559 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 POLIQ9UNA4 740 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 UBE4BO95155 1302 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SCN1AP35498 2009 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MTMR11A4FU01 709 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PRRG1O14668 218 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MICAL2O94851 1124 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF202O95125 648 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MYL1P05976 194 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 EPHA5P54756 1037 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RBP5P82980 135 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DPYDQ12882 1025 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NPAS3Q8IXF0 933 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TTC9BQ8N6N2 239 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MTMR12Q9C0I1 747 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GDAP2Q9NXN4 497 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DSEQ9UL01 958 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GABRDO14764 452 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms