RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SHTN1A0MZ66 631 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADM5C9JUS6 153 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 E9PLN8 166 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELFN1P0C7U0 828 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYBL2P10244 700 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ITIH3Q06033 890 aa3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 KAT5Q92993 513 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCAMP4Q969E2 229 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 GABRDO14764 452 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHRM2P08172 466 aa3.59□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC7BQ86TV6 843 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 POC1BQ8TC44 478 aa3.59□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ETAA1Q9NY74 926 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-601P-201ENST00000384540 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
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RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 F2RL2O00254 374 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHEK2O96017 543 aa3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBB3Q13509 450 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
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RNU6-601P-201ENST00000384540 GNAI1P63096 354 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 DSC2Q02487 901 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNAPC2Q13487 334 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 UAP1L1Q3KQV9 507 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTMR8Q96EF0 704 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR35Q9HC97 309 aa3.57□□□□□ -1.84
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