RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 SRLQ86TD4 932 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 PODXLO00592 558 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 IL18RAPO95256 599 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 MMP8P22894 467 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 LLGL1Q15334 1064 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 AMHR2Q16671 573 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 AKT3Q9Y243 479 aa25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.85■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 PARVAQ9NVD7 372 aa25.85■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.85■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 COL1A2P08123 1366 aa25.85■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 LRRC19Q9H756 370 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 VTNP04004 478 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 FNTAP49354 379 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 GPR162Q16538 588 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 GPR142Q7Z601 462 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 DPP9Q86TI2 863 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 BCAS4Q8TDM0 211 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.84■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 GJB6O95452 261 aa25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 STAG3L1P0CL83 205 aa25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 POLIQ9UNA4 740 aa25.83■■□□□ 1.73
ACSS1-202ENST00000376726 LACTBL1A8MY62 500 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 ERLIN2O94905 339 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 NFICP08651 508 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MCF2P10911 925 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 KCNJ1P48048 391 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 PLTPP55058 493 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MTHFD1LQ6UB35 978 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TFAP2BQ92481 460 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 CENPHQ9H3R5 247 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 SIX4Q9UIU6 781 aa25.83■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 H3BRB1 525 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 O00370 1275 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 KRT19P08727 400 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TMOD1P28289 359 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TAS2R40P59535 323 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TNFAIP2Q03169 654 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 CPB2Q96IY4 423 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 PSTPIP1O43586 416 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 GBP1P32455 592 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 GUCY1A3Q02108 690 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 GRB14Q14449 540 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 SGO2Q562F6 1265 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MAML3Q96JK9 1138 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.82■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 CALB1P05937 261 aa25.81■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 SMPD1P17405 629 aa25.81■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.81■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 JADE1Q6IE81 842 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 USTQ9Y2C2 406 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 ZEB2O60315 1214 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 LSP1P33241 339 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MAN1A1P33908 653 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 MDH1P40925 334 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.8■■□□□ 1.72
ACSS1-202ENST00000376726 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms