RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369592.1

SMNDC1-201, Transcript of survival motor neuron domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SMNDC1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1-201ENST00000369592 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF233A6NK53 670 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 OR6C75A6NL08 312 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 XYLBO75191 536 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ASGR2P07307 311 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 PRR29P0C7W0 189 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ODC1P11926 461 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 DPYDQ12882 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 GPR17Q13304 367 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 MYBPC2Q14324 1141 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 INTS13Q9NVM9 706 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 DMAC2Q9NW81 257 aa22.18■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.17■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 KCNK12Q9HB15 430 aa22.17■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.17■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.17■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM221A6NGB7 291 aa22.16■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 ANHXE9PGG2 379 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 M0R296 226 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 CYB561D2O14569 222 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 CLIC2O15247 247 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 RHOBTB3O94955 611 aa22.16■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 LAMP2P13473 410 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 FSHRP23945 695 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ARPP19P56211 112 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ADCY1Q08828 1119 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 SURF1Q15526 300 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.16■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM209Q96SK2 561 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 PHOX2BQ99453 314 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ITGB3P05106 788 aa22.15■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 MTMR3Q13615 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 SV2CQ496J9 727 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 WSCD1Q658N2 575 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 POTEHQ6S545 545 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ITFG1Q8TB96 612 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF560Q96MR9 790 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 EXOC1Q9NV70 894 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 DSEQ9UL01 958 aa22.15■■□□□ 1.14
SMNDC1-201ENST00000369592 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.15■■□□□ 1.14
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SMNDC1-201ENST00000369592 CYP24A1Q07973 514 aa22.14■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.14■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 WDR49Q8IV35 697 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 NXPE3Q969Y0 559 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CEP72Q9P209 647 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CDH7Q9ULB5 785 aa22.14■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 MTMR11A4FU01 709 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PRRG1O14668 218 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 RHOP08100 348 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CPB1P15086 417 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CYP2J2P51589 502 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 EPHA5P54756 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 RBP5P82980 135 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TDGQ13569 410 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 HTR4Q13639 388 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 KCNB1Q14721 858 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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