RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

BASIC

Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 SEMA4DQ92854 862 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 KCNK13Q9HB14 408 aa16.1■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 UTRNP46939 3433 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 B2RBV5 119 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 OR6B1O95007 311 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZWINTO95229 277 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 GZMAP12544 262 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 CYP11B1P15538 503 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ADSSP30520 456 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 NT5C2P49902 561 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 UBXN2AP68543 259 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 LIN52Q52LA3 116 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZNF276Q8N554 614 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 MBOAT7Q96N66 472 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 FNBP1Q96RU3 617 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 GALNT8Q9NY28 637 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 CCDC89Q8N998 374 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 HAUS1Q96CS2 278 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 PLVAPQ9BX97 442 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 EBF3Q9H4W6 596 aa16.09■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 H3BRJ5 948 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ANPEPP15144 967 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 SSTR1P30872 391 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 TAS2R40P59535 323 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.08■□□□□ 0.17
SNX18-202ENST00000343017 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 C6orf229H3BNL8 230 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 RIMBP2O15034 1052 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 SERPINB2P05120 415 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ENO1P06733 434 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ADRA2BP18089 450 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 DEUP1Q05D60 604 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ZWILCHQ9H900 591 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 F5H6K3 240 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 PIK3CDO00329 1044 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 KLRC2P26717 231 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ARL4CP56559 192 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 USP46P62068 366 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 GPS1Q13098 491 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 MYBPC3Q14896 1274 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.08■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 FCHO1O14526 889 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 OPHN1O60890 802 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 GRIA2P42262 883 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 PSMC4P43686 418 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 KDSRQ06136 332 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ECSITQ9BQ95 431 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 PICK1Q9NRD5 415 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 UFL1O94874 794 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 RARBP10826 455 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 MYL2P10916 166 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 TM4SF1P30408 202 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 TFDP1Q14186 410 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 TREML1Q86YW5 311 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 HSD17B14Q9BPX1 270 aa16.07■□□□□ 0.16
SNX18-202ENST00000343017 THTPAQ9BU02 230 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms