RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 DCLK3Q9C098 648 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 HACL1Q9UJ83 578 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 KAT6AQ92794 2004 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 GJB1P08034 283 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 GPC3P51654 580 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 C5orf60A6NFR6 353 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 DGAT1O75907 488 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NCOA4Q13772 614 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 RFX8Q6ZV50 586 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SEC14L1Q92503 715 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SH3GL3Q99963 347 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SUN1O94901 812 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TTC4O95801 387 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TARSP26639 723 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NRLP54845 237 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 EMC1Q8N766 993 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ANKEF1Q9NU02 776 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 GGA2Q9UJY4 613 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TTLL13PA6NNM8 815 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MUTP22033 750 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MSH2P43246 934 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MFSD7Q6UXD7 560 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 GRK7Q8WTQ7 553 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SNX3O60493 162 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SMIM24O75264 130 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CETPP11597 493 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CA4P22748 312 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CUL2Q13617 745 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 FITM2Q8N6M3 262 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF302Q9NR11 478 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 AAASQ9NRG9 546 aa21■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 GGPS1O95749 300 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ITIH2P19823 946 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 RAP1GAPP47736 663 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MPP2Q14168 576 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MYBPC2Q14324 1141 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 LPAR1Q92633 364 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CD101Q93033 1021 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CALN1Q9BXU9 219 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 F5H423 210 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 PLSCR1O15162 318 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CDO1Q16878 200 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 EMC10Q5UCC4 262 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 YY1P25490 414 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MAGEA4P43358 317 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 MYL6P60660 151 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TNFAIP1Q13829 316 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC89Q8N998 374 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 RAD23BP54727 409 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SP2Q02086 613 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 BBS9Q3SYG4 887 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 HSPH1Q92598 858 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS2-201ENST00000329078 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms