RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 ARID2Q68CP9 1835 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MPP2Q14168 576 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 SHC3Q92529 594 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TBK1Q9UHD2 729 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PEX11AO75192 247 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PEX5P50542 639 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ALCAMQ13740 583 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 NUP85Q9BW27 656 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CLUL1Q15846 466 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF653Q96CK0 615 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 GPRASP2Q96D09 838 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PASKQ96RG2 1323 aa20.56■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1B0GVG6 124 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 WFS1O76024 890 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TPBGLP0DKB5 382 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 HSPA6P17066 643 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ATP6V1C1P21283 382 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 RNF220Q5VTB9 566 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 LONP2Q86WA8 852 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PASD1Q8IV76 773 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ART4Q93070 314 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 GRIN3BO60391 1043 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 VPS41P49754 854 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 DCAF15Q66K64 600 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CROCCP2Q86T23 111 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 STK32AQ8WU08 396 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CLDN3O15551 220 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PSAPP07602 524 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 CHKAP35790 457 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 RFC5P40937 340 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ACAD9Q9H845 621 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ECEL1O95672 775 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 BTBD7Q9P203 1132 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 HAO1Q9UJM8 370 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MFAP3P55082 362 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 EMC2Q15006 297 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MFSD5Q6N075 450 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MOB2Q70IA6 237 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 VSIG1Q86XK7 387 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 FAM13CQ8NE31 585 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PWWP2AQ96N64 755 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 NT5C1BQ96P26 610 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 NPTXRO95502 500 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 KYNUQ16719 465 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM50Q86XT4 487 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 GPD1LQ8N335 351 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 KIFAP3Q92845 792 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF554-201ENST00000317243 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms