RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 AP5Z1O43299 807 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TTC13Q8NBP0 860 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 DISC1Q9NRI5 854 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 AIM2O14862 343 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 DMTF1Q9Y222 760 aa15.02■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 LRRN2O75325 713 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 EPHB2P29323 1055 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 MXI1P50539 228 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CRB1P82279 1406 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 BNC1Q01954 994 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 KCNA1Q09470 495 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RNF220Q5VTB9 566 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SAR1AQ9NR31 198 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 GIN1Q9NXP7 522 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 MAPK11Q15759 364 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 JAMLQ86YT9 394 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RFFLQ8WZ73 363 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 OTUD5Q96G74 571 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TIPINQ9BVW5 301 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PFASO15067 1338 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB5O15062 677 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PRCPP42785 496 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ABI1Q8IZP0 508 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CENPTQ96BT3 561 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 APOL4Q9BPW4 351 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 VWA5AO00534 786 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 MAFGO15525 162 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 MED26O95402 600 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ETS2P15036 469 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 DYNLT1P63172 113 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC41Q15345 812 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 DGUOKQ16854 277 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 HPS1Q92902 700 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 FAF2Q96CS3 445 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CENPXA8MT69 81 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 RAD51BO15315 384 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 OLR1P78380 273 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PLIN5Q00G26 463 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM69Q86WT6 500 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D12O60347 775 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CYP4A11Q02928 519 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TRAF2Q12933 501 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SLC12A1Q13621 1099 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 LPIN1Q14693 890 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 EPAS1Q99814 870 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ITM2BQ9Y287 266 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SNPHO15079 494 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SLC4A1P02730 911 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 USP17L8P0C7I0 530 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCA1P28370 1054 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ARL4AP40617 200 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CNDP1Q96KN2 507 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 UTYO14607 1347 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3R2O00459 728 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 CNGA2Q16280 664 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 KRT73Q86Y46 540 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 OR8H2Q8N162 312 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 VPS11Q9H270 941 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-201ENST00000281171 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms